بهروز امرائی دارای ليسانس علوم دريايي از دانشكده افسري نيروي دريايي (1355). گذرانيدن دوره عالي پيلوتاژ در دانشكده دريايي UWIST (انگلستان) 1979. دوره مديريت آموزشي دريايي و بندري (هلند). فوق ليسانس تعليم و تربيت دريايي، از دانشگاه جهاني دريانوردي، مالمو، سوئد (1987). دكترا در رشته حمل و نقل دريايي و مديريت بنادر در دانشگاه ويلز كارديف (انگلستان) 1995. می باشد.