فصل پانزدهم: رویکردهای بیزی در فیلوژنتیک؟
فصل شانزدهم: ناسازگاری درختان ژن
فصل هفدهم: برنامهها و وبسایتهای فیلوژنتیکی
فصل هجدهم: ژنتیک جمعیت و ژنوم
فصل نوزدهم: رویکردهای ژنومیک جمعیت
فصل بیستم: آشکارسازی انتخاب اصلح: مبانی
فصل بیست و یکم: تدقیق انتخاب اصلح در سطح مولکولی
فصل بیست و دوم: ساخت ماتریسهای فیلوژنومی
فصل بیست و سوم: فیلوژنومیک و درخت حیات
فصل بیست و چهارم: ژنومیک تطبیقی
فصل بیست و پنجم: DNA محیطی
فصل بیست و ششم: شناخت کارکرد و تکامل ژن
پیوست الف: تبدیل حرف متن به کد بیولوژیکی سطح 1
کتاب مبانی فیلوژنومیک - جلد دوم