فصل اول: فیلوژنومیک چیست؟ فصل دوم: بیولوژی و تواالییابی اطلاعات ژنتیکی فصل سوم: قواعد تکامل فصل چهارم: مبانی ذخیره دادهها فصل پنجم: ترازیابی توالی فصل ششم: ترازیابیهای چندگانه فصل هفتم: توالییابی و توضیح ژنوم فصل هشتم: پایگاههای داده ژنومی فصل نهم: پایگاههای داده Amplicon فصل دهم: مبانی ساخت درخت فصل یازدهم: فاصله و خوشهبندی فصل دوازدهم: شایدی آماری فصل سیزدهم: راهبردهای جستجو و ستبری فصل چهاردهم: مشکلات پردازش دادهها