هرکدام از اندام ها و فرایندهای مختلف زیستی و گوارشی، از عوامل ضروری برای گوارش و جذب مناسب غذا به شمار می روند. با این حال، این دستگاه که کاملا تنظیم شده است، می تواند باعث ایجاد مشکلاتی نیز شود. بسیاری از عوامل بر عملکردهای معدی- روده ای تاثیر می گذارند. دستگاه عصبی مرکزی، تاثیر عمده ای را از طریق ارتباطات متقابل عصبی- غدد درون ریز برجای می نهد. حالت عاطفی و احساساتی می تواند با درجات متفاوت، بر عملکرد گوارشی تاثیر داشته باشد. برای مثال، بسیاری از افراد گرفتگی روده و مشکلات محدودی را در شرایط پرتنش مانند یک قرار ملاقات مهم یا یک بازی بزرگ تجربه می کنند. برخی از افراد در هنگامی که خون خود را می بینند دچار «ناراحتی معده» می شوند و به خوبی مشخص است فشار عاطفی با ایجاد ناهنجاری های معده ارتباط دارد. شواهد اخیر نشان می دهد اغلب مشکلات معدی- روده ای را می توان با پیروی از یک رژیم غذایی سالم و انجام ورزش های منظم و مناسب درمان کرد. به طور مثال انجام فعالیت ورزشی منظم، سبب افزایش سرعت تخلیه معده و کاهش احتمال ابتلا به بیماری های کبدی، سنگ مثانه، سرطان کولون و یبوست می شود.
مشکلاتی که با هرگونه فرایند یا اندام گوارشی همراه است، می تواند از جذب مواد مغذی کافی جلوگیری کند و بدین ترتیب تاثیری منفی بر شرایط تغذیه ای فرد داشته باشد. برای مثال مشکلات دندانی، جویدن را مشکل می سازد و نوع غذاهایی که قابل مصرف است را محدود می نماید. این موضوع باعث کاهش تماس بین مواد مغذی موجود در غذاها و آنزیم های گوارشی خواهد شد. مشکلات لوزالمعده می تواند باعث محدودسازی قابلیت دسترسی آنزیم های مورد نیاز برای گوارش چربی ها و پروتئین ها شود. مشکلات کبدی یا کیسه صفرا، ممکن است برای جذب چربی ها ایجاد اختلال کند… هرچقدر مطالب بیشتری در مورد این شرایط بدانیم، به نحو مطلوب تری قادر به پیشگیری یا کاهش مشکلات ناشی از آن ها خواهیم بود.